浙江中醫(yī)藥大學(xué)是全國(guó)首批具有碩士學(xué)位授予權(quán)的高校之一。1978年開(kāi)始招收碩士學(xué)位研究生；1998年獲得博士學(xué)位授予權(quán)；2000年獲準(zhǔn)開(kāi)展臨床醫(yī)學(xué)（中醫(yī)、中西醫(yī)結(jié)合）碩士專業(yè)學(xué)位工作；2003年獲得中藥學(xué)一級(jí)學(xué)科博士授予權(quán)，獲準(zhǔn)設(shè)立中醫(yī)學(xué)一級(jí)學(xué)科博士后科研流動(dòng)站；2006年成為推薦優(yōu)秀應(yīng)屆本科畢業(yè)生免試攻讀碩士學(xué)位研究生工作單位；2007年獲準(zhǔn)設(shè)立中藥學(xué)一級(jí)學(xué)科博士后科研流動(dòng)站；2011年獲得中醫(yī)學(xué)一級(jí)學(xué)科博士授予權(quán)，臨床醫(yī)學(xué)、藥學(xué)一級(jí)學(xué)科碩士授予權(quán)；2012年獲準(zhǔn)設(shè)立中西醫(yī)結(jié)合一級(jí)學(xué)科博士后流動(dòng)站；2018年獲得中西醫(yī)結(jié)合一級(jí)學(xué)科博士授予權(quán)。

目前學(xué)校博士學(xué)位點(diǎn)覆蓋中醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合、中藥學(xué)3個(gè)一級(jí)學(xué)科；碩士學(xué)位點(diǎn)覆蓋中醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合、中藥學(xué)、馬克思主義理論、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、護(hù)理學(xué)9個(gè)一級(jí)學(xué)科。專業(yè)學(xué)位包括中醫(yī)博士與碩士、臨床醫(yī)學(xué)碩士、生物與醫(yī)藥碩士、口腔醫(yī)學(xué)碩士、公共衛(wèi)生碩士、護(hù)理碩士、藥學(xué)碩士、中藥學(xué)碩士、醫(yī)學(xué)技術(shù)碩士、公共管理碩士10個(gè)專業(yè)學(xué)位點(diǎn)。目前已形成以中醫(yī)藥為主體，多學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展，學(xué)位類型齊全，培養(yǎng)層次完備的高層次人才培養(yǎng)格局，以及學(xué)術(shù)學(xué)位與專業(yè)學(xué)位并重發(fā)展的學(xué)位與研究生教育體系。學(xué)校現(xiàn)有博士生導(dǎo)師253人，碩士生導(dǎo)師1620人。現(xiàn)有在校研究生5678人，其中博士研究生555人（學(xué)術(shù)型296人、專業(yè)型259人），碩士研究生5123人（學(xué)術(shù)型1481人、專業(yè)型3642人）。